L'ONDRAF a établi un système de gestion des déchets radioactifs destiné à garantir la protection de l'homme et de son environnement contre les dangers potentiels de ces déchets. Ce système de gestion vise prioritairement à garantir la sûreté. Il s'appuie pour ce faire essentiellement sur deux principes, que l'ONDRAF applique à toutes les phases de la gestion: d'une part, le confinement des substances radioactives, de sorte qu'elles ne puissent se disperser dans l'environnement, et d'autre part, le blindage contre les rayonnements ionisants.

Le système de gestion de l'ONDRAF comprend deux aspects :

	un système intégré ;
	un système d'acceptation.

La sûreté de la gestion des déchets radioactifs ne repose pas uniquement sur la qualité de la conception et de la réalisation des infrastructures de traitement, d'entreposage provisoire ou de dépôt final. Elle repose aussi sur la qualité des déchets que l'ONDRAF accepte. Pour pouvoir être gérés en toute sûreté, tant à court qu'à long terme, les déchets transférés à l'ONDRAF doivent satisfaire à des exigences spécifiques.

Ceci est garanti, au sein d'un système d'acceptation (*), par une succession d'opérations en trois étapes :

	l'établissement, par l'ONDRAF, de critères d'acceptation ;
	l'agrément (ou qualification), par l'ONDRAF, des installations de traitement/conditionnement et d'entreposage, y compris les installations et méthodes de mesure utilisées pour la caractérisation des déchets ;
	l'acceptation, par l'ONDRAF, des déchets radioactifs conformes aux critères d'acceptation.

(*) Le système d'acceptation mis au point par l'ONDRAF est certifié selon la norme internationale ISO 9001:2000.